Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL3O95236 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL3O95236 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms