Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABARAPO95166 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms