Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS6KA4O75676 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPS6KA4O75676 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms