Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms