Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BRD4O60885 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BRD4O60885 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BRD4O60885 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRD4O60885 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms