Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GMDSO60547 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GMDSO60547 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms