Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CREB3O43889 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CREB3O43889 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CREB3O43889 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms