Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ2O43526 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ2O43526 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms