Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRTM2O43300 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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