Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGEF10O15013 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms