Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E9PBE3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E9PBE3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E9PBE3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E9PBE3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms