Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF879B4DU55 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms