Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL1BA8MQ27 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEURL1BA8MQ27 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms