Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HSPB2A8KAH6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms