Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TVP23AA6NH52 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms