Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms