Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PALM3A6NDB9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms