Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB5A4FU69 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB5A4FU69 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms