Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGKV1-27A0A075B6S5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV1-27A0A075B6S5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms