Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms