Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAXBP1Q9Y5B6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms