Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC8Q9Y2L5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms