Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DTX4Q9Y2E6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms