Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX12Q9UMY4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms