Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO3Q9UK99 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO3Q9UK99 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms