Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTNNA3Q9UI47 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms