Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA9Q9UGM1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms