Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCF2Q9UG63 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF2Q9UG63 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms