Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PODXL2Q9NZ53 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PODXL2Q9NZ53 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms