Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TVP23BQ9NYZ1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms