Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RDH8Q9NYR8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RDH8Q9NYR8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms