Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A12Q9NXJ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A12Q9NXJ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms