Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC39A9Q9NUM3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC39A9Q9NUM3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms