Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG3Q9NT62 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG3Q9NT62 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms