Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SLC6A13Q9NSD5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms