Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDHAF3Q9NRP4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms