Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms