Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB9BQ9NP90 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms