Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ELL3Q9HB65 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELL3Q9HB65 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms