Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC52A2Q9HAB3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms