Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GPR88Q9GZN0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms