Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SEMA4CQ9C0C4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms