Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM8Q9BZR9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms