Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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