Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms