Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM55Q9BYV6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms