Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SRRTQ9BXP5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRRTQ9BXP5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms