Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CINPQ9BW66 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms