Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RIOK2Q9BVS4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RIOK2Q9BVS4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms