Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCMBPQ9BTE3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms